Bakterije višak vode izbacuju bilo gde na telu, a mogu da se hrane: autotrofno, heterotrofno, sapotrofno.
Modrozelene bakterije imaju sposobnost da vrše fotosintezu, što znači da se hrane autotrofno. Žive u vodenim staništima ili na vlažnim mestima.
Helikobakterija se hrani heterotrofno. Živi parazitski u želucu i crevima čoveka. Ukoliko se prenamnoži, usled nepravilne ishrane, izaziva oboljenja.
Bakterije koje žive u zemljištu se hrane sapotrofno. Razlažu uginule organizme i izazivaju njihovo truljenje.