Osim biljaka, vakuole imaju i ćelije gljive, bakterije, protisti, pa i neke životinjske ćelije.
Kod ameba postoji hranljiva vakuola. Kada ameba hvata plen, ona ga opkoli svojim telom i na tom mestu napravi hranljivu vakuolu u kojoj vari svoj plen.
Osim hranljive vakuole, ameba ima i kontraktilnu vakuolu. Ona ima ulogu u izlučivanju, odnosno izbacuje višak vode.
Papučica ili paramecijum je jedan od najpoznatijih rodova trepljara. On ima dve kontraktilne vakuole (za izbacivanje vode) i ima hranljivu vakuolu (za ishranu).
